Trường Đại học Dân lập Phú Xuân được thành lập bởi Hội Khuyến học Thừa Thiên – Huế theo Quyết định số 140/2003/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ.
TS. Nguyễn Đình Ngộ, nguyên là Phó Chủ tịch UBND Tỉnh Thừa Thiên Huế (Nhiệm kì 1989 - 1994), nguyên Trưởng ty Giáo dục Tỉnh và là Đại biểu quốc hội liên tục 3 khoá (Khóa VII đến khóa IX), trở thành Hiệu trưởng đầu tiên của Trường.
Đánh dấu một bước chuyển mình mạnh mẽ của Trường Đại học Dân lập Phú Xuân với việc nhận đầu tư từ Tổ chức giáo dục EQuest - Tổ chức giáo dục tư nhân lớn nhất tại Việt Nam
Trường được chuyển đổi loại hình trường từ dân lập sang tư thục theo quyết định số 1812/QĐ–TTg của Thủ tướng Chính phủ.
Trường công bố Tầm nhìn, Sứ mệnh của Trường trong giai đoạn mới (Quyết định số 139/2019/QĐ-PXU)
Trường công bố và triển khai thực hiện Chiến lược phát triển của Trường giai đoạn 2021 - 2030, tầm nhìn đến 2035 (Quyết định số 08/2019/QĐ-PXU)
Trường áp dụng Hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2015 theo Quyết định số 185/2020/QĐ-PXU
Trường được trao giấy Chứng nhận Kiểm định chất lượng Cơ sở giáo dục (Quyết định số 472/QĐ-KĐCLV của Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục Vinh)